MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 3965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017741	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017741	TGG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017741	ATGC	2	8	4281	4288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017741	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017741	GTG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017741	ACC	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017741	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017741	A	7	7	4579	4585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017741	T	8	8	4599	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017741	AAT	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017741	GAAAC	2	10	4649	4658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017741	TAAA	2	8	4689	4696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017741	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017741	ATT	2	6	4814	4819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017741	T	7	7	4832	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017741	A	6	6	4843	4848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017741	A	6	6	4859	4864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017741	TGT	2	6	4898	4903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017741	TTTTA	2	10	4922	4931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017741	TC	3	6	4967	4972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017741	A	8	8	4999	5006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017741	A	6	6	5015	5020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017741	T	7	7	5216	5222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017741	CATT	2	8	5282	5289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017741	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017741	TGG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017741	A	6	6	5514	5519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017741	C	6	6	5534	5539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_017741	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017741	GTT	2	6	5604	5609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017741	TAA	2	6	5673	5678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017741	TTA	2	6	5731	5736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017741	GTG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017741	GTT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017741	GTGC	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017741	TCT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017741	C	6	6	5966	5971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_017741	ATG	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017741	AGT	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017741	AGA	2	6	6150	6155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017741	AC	3	6	6280	6285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017741	TTGT	2	8	6331	6338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017741	CTT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017741	TAG	4	12	6414	6425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017741	TGT	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017741	GTT	2	6	6481	6486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017741	TTG	2	6	6514	6519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017741	TGGT	2	8	6631	6638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017741	ATCG	2	8	6805	6812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017741	GTT	2	6	6832	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017741	CGTT	2	8	6840	6847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017741	A	6	6	6979	6984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017741	GA	7	14	7013	7026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017741	T	7	7	7036	7042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017741	T	6	6	7047	7052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017741	TAAAT	2	10	7059	7068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017741	TGT	2	6	7169	7174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017741	A	12	12	7178	7189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017741	T	6	6	7192	7197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017741	TGT	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017741	TAA	2	6	8993	8998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017741	ATAA	2	8	9382	9389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017741	TAA	2	6	9472	9477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017741	ATT	2	6	9491	9496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017741	CAA	2	6	9559	9564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017741	T	6	6	9568	9573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017741	ATTC	2	8	9585	9592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017741	ACA	2	6	9602	9607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017741	GAA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017741	T	6	6	12372	12377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017741	A	6	6	12412	12417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017741	T	6	6	12439	12444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017741	AGG	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017741	GCTTT	2	10	13303	13312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017741	T	6	6	13310	13315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017741	T	7	7	13372	13378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017741	ATA	2	6	13382	13387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017741	TTAA	2	8	13401	13408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017741	AGTT	2	8	16349	16356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017741	CA	3	6	16410	16415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017741	CTG	2	6	16431	16436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017741	A	6	6	16566	16571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017741	A	6	6	18005	18010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017741	AAACAC	2	12	18040	18051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017741	AATC	3	12	22454	22465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017741	AAAAG	2	10	22731	22740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017741	AAG	2	6	22749	22754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017741	CTT	2	6	24883	24888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017741	GATT	2	8	24896	24903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017741	ATTA	2	8	24992	24999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017741	CAA	2	6	25016	25021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017741	A	12	12	25020	25031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017741	A	6	6	26719	26724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017741	T	6	6	26754	26759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017741	A	6	6	26797	26802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017741	TA	3	6	26816	26821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017741	T	6	6	28156	28161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017741	A	6	6	28188	28193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017741	TCA	2	6	29737	29742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017741	T	6	6	29785	29790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017741	GGTT	2	8	29872	29879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017741	AGC	2	6	30305	30310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017741	T	8	8	35531	35538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017741	TTA	2	6	35540	35545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017741	A	7	7	35590	35596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017741	TAA	2	6	38490	38495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017741	A	8	8	38500	38507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017741	AG	3	6	38512	38517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017741	GATT	2	8	42250	42257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017741	TGA	2	6	48170	48175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017741	TTAA	2	8	48184	48191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017741	TTTA	2	8	53312	53319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017741	GCGG	2	8	53350	53357	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017741	T	6	6	53383	53388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017741	TAAT	2	8	53412	53419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017741	TTGT	2	8	53490	53497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017741	TAA	3	9	53518	53526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017741	TTAAA	2	10	53581	53590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017741	A	6	6	53600	53605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017741	ACAAA	2	10	53610	53619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017741	G	7	7	53871	53877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017741	GTG	2	6	53973	53978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017741	A	7	7	54006	54012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017741	TC	3	6	54166	54171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017741	TCT	2	6	54198	54203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017741	A	8	8	54235	54242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017741	GAA	2	6	54243	54248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017741	AGA	2	6	54266	54271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017741	CAA	2	6	54275	54280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017741	AGA	2	6	54287	54292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017741	A	6	6	54305	54310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017741	AGAAAA	2	12	54332	54343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017741	TAG	2	6	56089	56094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017741	GAA	2	6	56139	56144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017741	A	6	6	56160	56165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017741	AGA	3	9	56174	56182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017741	CAAG	2	8	56195	56202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017741	TAA	2	6	56228	56233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017741	CTT	2	6	56239	56244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017741	TGA	2	6	56258	56263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017741	A	6	6	56323	56328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017741	GATGTG	2	12	56352	56363	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017741	ATA	2	6	56401	56406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017741	AAAG	2	8	56493	56500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017741	AGA	2	6	56546	56551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017741	TGCT	2	8	56664	56671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017741	CT	3	6	56670	56675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017741	TGG	2	6	56678	56683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017741	A	6	6	56705	56710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017741	TAG	2	6	56728	56733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017741	ACC	2	6	56779	56784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_017741	T	7	7	56877	56883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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